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Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.7 KB  |  38 lines
  1. *******************************************
  2. * Glycosyl hydrolases family 17 signature *
  3. *******************************************
  4.  
  5. It has been shown [1,2] that  the following glycosyl hydrolases can be, on the
  6. basis of sequence similarities, classified into a single family:
  7.  
  8.  - Glucan  endo-1,3-beta-glucosidases    (EC 3.2.1.39)      (endo-(1->3)-beta-
  9.    glucanase) from various plants.  This enzyme may be involved in the defense
  10.    of plants against pathogens through its ability to degrade fungal cell wall
  11.    polysaccharides.
  12.  - Glucan 1,3-beta-glucosidase (EC 3.2.1.58)  (exo-(1->3)-beta-glucanase) from
  13.    yeast (gene BGL2). This enzyme  may play  a  role  in cell expansion during
  14.    growth, in cell-cell  fusion  during  mating,  and  in spore release during
  15.    sporulation.
  16.  - Lichenases (EC 3.2.1.73)   (endo-(1->3,1->4)-beta-glucanase)  from  various
  17.    plants.
  18.  
  19. The best conserved region in the sequence of these enzymes is located in their
  20. central section. This  region  contains  a  conserved tryptophan residue which
  21. could be involved in  the  interaction with  the  glucan substrates [2] and it
  22. also contains a conserved glutamate  which  could be involved in the catalytic
  23. mechanism. We have used this region as a signature pattern.
  24.  
  25. -Consensus pattern: [LIVM]-x-[LIVMFYW](3)-[STAG]-E-[ST]-G-W-P-[ST]-x-G
  26. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  27. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  28.  
  29. -Expert(s) to contact by email: Henrissat B.
  30.                                 bernie@cermav.grenet.fr
  31.  
  32. -Last update: December 1992 / Text revised.
  33.  
  34. [ 1] Henrissat B.
  35.      Biochem. J. 280:309-316(1991).
  36. [ 2] Ori N., Sessa G., Lotan T., Himmelhoch S., Fluhr R.
  37.      EMBO J. 9:3429-3436(1990).
  38.